Громадська організація «Асоціація підприємців м. Києва» була створена під назвою «Асоціація власників малого бізнесу та малих архітектурних форм» 19 листопада 2009 року. Організацію було перейменовано в 2012 році у зв’язку з розширенням сфери діяльності.
в.о. Президента України Олександр Турчинов звільнив (указ №264/2014) Голову Київської міської державної адміністрації Володимира Макеєнко, який обіймав дану посаду з 25 січня 2014 року.
